Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NFX1Q12986 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
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