Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB40BQ12829 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB40BQ12829 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB40BQ12829 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB40BQ12829 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB40BQ12829 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB40BQ12829 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB40BQ12829 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB40BQ12829 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB40BQ12829 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB40BQ12829 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB40BQ12829 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAB40BQ12829 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAB40BQ12829 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB40BQ12829 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms