Protein–RNA interactions for Protein: Q12815

TROAP, Tastin, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAPQ12815 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TROAPQ12815 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TROAPQ12815 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
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