Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TFCP2Q12800 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TFCP2Q12800 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TFCP2Q12800 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TFCP2Q12800 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TFCP2Q12800 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TFCP2Q12800 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
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