Protein–RNA interactions for Protein: Q12378

RTR2, RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RTR2, yeastyeast

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTR2Q12378 APE1YKL103C 1545 nt3.99□□□□□ -1.77
RTR2Q12378 NUP133YKR082W 3474 nt3.98□□□□□ -1.77
RTR2Q12378 PUT1YLR142W 1431 nt3.98□□□□□ -1.77
RTR2Q12378 RAD52YML032C 1416 nt3.98□□□□□ -1.77
RTR2Q12378 HCM1YCR065W 1695 nt3.98□□□□□ -1.77
RTR2Q12378 BBC1YJL020C 3474 nt3.98□□□□□ -1.77
RTR2Q12378 RPS13YDR064W 456 nt3.98□□□□□ -1.77
RTR2Q12378 IRC9YJL142C 393 nt3.98□□□□□ -1.77
RTR2Q12378 YMR130WYMR130W 909 nt3.98□□□□□ -1.77
RTR2Q12378 YPL191CYPL191C 1083 nt3.98□□□□□ -1.77
RTR2Q12378 TDA11YHR159W 1515 nt3.98□□□□□ -1.77
RTR2Q12378 HMG1YML075C 3165 nt3.98□□□□□ -1.77
RTR2Q12378 KCC4YCL024W 3114 nt3.98□□□□□ -1.77
RTR2Q12378 SSH1YBR283C 1473 nt3.98□□□□□ -1.77
RTR2Q12378 PRP9YDL030W 1593 nt3.97□□□□□ -1.77
RTR2Q12378 EMP47YFL048C 1338 nt3.97□□□□□ -1.77
RTR2Q12378 ATG2YNL242W 4779 nt3.97□□□□□ -1.77
RTR2Q12378 SOL4YGR248W 768 nt3.97□□□□□ -1.77
RTR2Q12378 YGP1YNL160W 1065 nt3.97□□□□□ -1.77
RTR2Q12378 PWR1PWR1 941 nt3.97□□□□□ -1.77
RTR2Q12378 YMR111CYMR111C 1389 nt3.97□□□□□ -1.77
RTR2Q12378 SAF1YBR280C 1914 nt3.97□□□□□ -1.77
RTR2Q12378 MSC2YDR205W 2175 nt3.96□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 RSC3YDR303C 2658 nt3.96□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 TRK1YJL129C 3708 nt3.96□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 IPK1YDR315C 846 nt3.96□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 LSB1YGR136W 726 nt3.96□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 AAD10YJR155W 867 nt3.96□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 SLZ1YNL196C 897 nt3.96□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 UBA3YPR066W 900 nt3.96□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 SRB6YBR253W 366 nt3.96□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 NVJ1YHR195W 966 nt3.95□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 AIF1YNR074C 1137 nt3.95□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 VPS45YGL095C 1734 nt3.95□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 MKS1YNL076W 1755 nt3.94□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 SWI3YJL176C 2478 nt3.94□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 THI13YDL244W 1023 nt3.94□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 ARG82YDR173C 1068 nt3.94□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 SNA2YDR525W-A 240 nt3.94□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 LSO1YJR005C-A 282 nt3.94□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 THI11YJR156C 1023 nt3.94□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 YLR156WYLR156W 345 nt3.94□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt3.94□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 YLR159WYLR159W 345 nt3.94□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 YLR161WYLR161W 345 nt3.94□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 APS1YLR170C 471 nt3.94□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 REI1YBR267W 1182 nt3.94□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 PBN1YCL052C 1251 nt3.94□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 MET12YPL023C 1974 nt3.94□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 BUD7YOR299W 2241 nt3.94□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 TPA1YER049W 1935 nt3.93□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 APC4YDR118W 1959 nt3.93□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 RSM10YDR041W 612 nt3.93□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 NTH1YDR001C 2256 nt3.93□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 GIP4YAL031C 2283 nt3.93□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 RTA1YGR213C 954 nt3.92□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 YLR125WYLR125W 411 nt3.92□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 REX4YOL080C 870 nt3.92□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 YDC1YPL087W 954 nt3.92□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt3.92□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt3.92□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 SAP4YGL229C 2457 nt3.92□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 LPL1YOR059C 1353 nt3.91□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 BUD8YLR353W 1812 nt3.91□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt3.91□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 ORM2YLR350W 651 nt3.91□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 MNL1YHR204W 2391 nt3.91□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 RPO31YOR116C 4383 nt3.9□□□□□ -1.78
RTR2Q12378 YDL094CYDL094C 510 nt3.9□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 ECM1YAL059W 639 nt3.9□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 SRP40YKR092C 1221 nt3.9□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 IES3YLR052W 753 nt3.9□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 STP22YCL008C 1158 nt3.9□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 BCK2YER167W 2556 nt3.89□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 YEH2YLR020C 1617 nt3.89□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 SPR6YER115C 576 nt3.89□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 SKI6YGR195W 741 nt3.89□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 NPT1YOR209C 1290 nt3.89□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 BIK1YCL029C 1323 nt3.89□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 MCM2YBL023C 2607 nt3.89□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 NOP7YGR103W 1818 nt3.88□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 PTR2YKR093W 1806 nt3.88□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 TAF12YDR145W 1620 nt3.88□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 OAF1YAL051W 3144 nt3.88□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 TYW3YGL050W 822 nt3.88□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 MVD1YNR043W 1191 nt3.88□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 PEP4YPL154C 1218 nt3.88□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 RPN6YDL097C 1305 nt3.88□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 FAS2YPL231W 5664 nt3.88□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 PRM7YDL039C 2097 nt3.87□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 YGL088WYGL088W 366 nt3.87□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 COX4YGL187C 468 nt3.87□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 RFU1YLR073C 603 nt3.87□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 YNL057WYNL057W 333 nt3.87□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 YPT53YNL093W 663 nt3.87□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 FSH3YOR280C 801 nt3.87□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 TIF5YPR041W 1218 nt3.87□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 ATG14YBR128C 1035 nt3.87□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 GPI10YGL142C 1851 nt3.86□□□□□ -1.79
RTR2Q12378 YPR003CYPR003C 2265 nt3.86□□□□□ -1.79
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