Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
APOBRQ0VD83 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms