Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EP300Q09472 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EP300Q09472 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EP300Q09472 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EP300Q09472 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EP300Q09472 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EP300Q09472 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EP300Q09472 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EP300Q09472 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EP300Q09472 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EP300Q09472 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EP300Q09472 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EP300Q09472 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EP300Q09472 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EP300Q09472 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EP300Q09472 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EP300Q09472 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EP300Q09472 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EP300Q09472 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EP300Q09472 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EP300Q09472 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EP300Q09472 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EP300Q09472 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EP300Q09472 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EP300Q09472 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EP300Q09472 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EP300Q09472 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EP300Q09472 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EP300Q09472 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EP300Q09472 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EP300Q09472 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EP300Q09472 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EP300Q09472 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EP300Q09472 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EP300Q09472 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EP300Q09472 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EP300Q09472 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EP300Q09472 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EP300Q09472 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EP300Q09472 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EP300Q09472 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EP300Q09472 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EP300Q09472 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EP300Q09472 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EP300Q09472 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EP300Q09472 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EP300Q09472 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EP300Q09472 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EP300Q09472 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EP300Q09472 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EP300Q09472 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EP300Q09472 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EP300Q09472 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EP300Q09472 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
EP300Q09472 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
EP300Q09472 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EP300Q09472 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EP300Q09472 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EP300Q09472 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EP300Q09472 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EP300Q09472 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EP300Q09472 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EP300Q09472 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EP300Q09472 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EP300Q09472 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EP300Q09472 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EP300Q09472 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EP300Q09472 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EP300Q09472 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EP300Q09472 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EP300Q09472 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EP300Q09472 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EP300Q09472 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EP300Q09472 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EP300Q09472 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EP300Q09472 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EP300Q09472 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EP300Q09472 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EP300Q09472 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EP300Q09472 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EP300Q09472 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EP300Q09472 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EP300Q09472 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EP300Q09472 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EP300Q09472 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EP300Q09472 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EP300Q09472 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EP300Q09472 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EP300Q09472 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EP300Q09472 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EP300Q09472 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EP300Q09472 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EP300Q09472 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EP300Q09472 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EP300Q09472 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EP300Q09472 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EP300Q09472 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EP300Q09472 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EP300Q09472 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EP300Q09472 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms