Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SSRP1Q08945 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms