Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms