Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRTAP1-1Q07627 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRTAP1-1Q07627 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms