Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PAX8Q06710 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms