Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD51Q06609 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms