Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EXOSC9Q06265 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EXOSC9Q06265 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms