Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTN2Q02246 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTN2Q02246 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms