Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TNFRSF17Q02223 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF17Q02223 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms