Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC42EP1Q00587 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC42EP1Q00587 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms