Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms