Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFAMQ00059 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFAMQ00059 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFAMQ00059 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms