Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

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Length 4,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PKD1P98161 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PKD1P98161 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PKD1P98161 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PKD1P98161 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PKD1P98161 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKD1P98161 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKD1P98161 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKD1P98161 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKD1P98161 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKD1P98161 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKD1P98161 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKD1P98161 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKD1P98161 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKD1P98161 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKD1P98161 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKD1P98161 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKD1P98161 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKD1P98161 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKD1P98161 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKD1P98161 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKD1P98161 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKD1P98161 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKD1P98161 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKD1P98161 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKD1P98161 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKD1P98161 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKD1P98161 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKD1P98161 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKD1P98161 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PKD1P98161 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKD1P98161 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PKD1P98161 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKD1P98161 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKD1P98161 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKD1P98161 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKD1P98161 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKD1P98161 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKD1P98161 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKD1P98161 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKD1P98161 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKD1P98161 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKD1P98161 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKD1P98161 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKD1P98161 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKD1P98161 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PKD1P98161 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKD1P98161 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKD1P98161 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PKD1P98161 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKD1P98161 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKD1P98161 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKD1P98161 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKD1P98161 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKD1P98161 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKD1P98161 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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PKD1P98161 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKD1P98161 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PKD1P98161 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKD1P98161 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKD1P98161 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PKD1P98161 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PKD1P98161 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKD1P98161 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PKD1P98161 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKD1P98161 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKD1P98161 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKD1P98161 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKD1P98161 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKD1P98161 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKD1P98161 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKD1P98161 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PKD1P98161 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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PKD1P98161 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKD1P98161 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PKD1P98161 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKD1P98161 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PKD1P98161 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKD1P98161 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKD1P98161 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PKD1P98161 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PKD1P98161 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PKD1P98161 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PKD1P98161 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PKD1P98161 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PKD1P98161 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PKD1P98161 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PKD1P98161 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PKD1P98161 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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