Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED6P86452 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED6P86452 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms