Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPCAP84074 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPCAP84074 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPCAP84074 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPCAP84074 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPCAP84074 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPCAP84074 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPCAP84074 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPCAP84074 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPCAP84074 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPCAP84074 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPCAP84074 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPCAP84074 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPCAP84074 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPCAP84074 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HPCAP84074 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPCAP84074 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPCAP84074 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPCAP84074 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPCAP84074 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPCAP84074 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPCAP84074 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAP84074 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAP84074 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAP84074 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAP84074 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAP84074 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAP84074 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAP84074 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAP84074 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAP84074 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAP84074 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAP84074 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAP84074 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAP84074 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAP84074 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAP84074 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAP84074 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAP84074 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAP84074 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAP84074 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPCAP84074 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPCAP84074 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPCAP84074 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPCAP84074 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPCAP84074 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPCAP84074 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPCAP84074 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPCAP84074 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPCAP84074 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPCAP84074 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAP84074 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAP84074 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAP84074 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAP84074 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAP84074 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAP84074 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAP84074 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAP84074 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAP84074 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAP84074 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAP84074 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAP84074 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPCAP84074 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPCAP84074 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPCAP84074 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HPCAP84074 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPCAP84074 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPCAP84074 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPCAP84074 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPCAP84074 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HPCAP84074 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HPCAP84074 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HPCAP84074 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HPCAP84074 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HPCAP84074 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HPCAP84074 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPCAP84074 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPCAP84074 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPCAP84074 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPCAP84074 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPCAP84074 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HPCAP84074 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HPCAP84074 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPCAP84074 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HPCAP84074 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPCAP84074 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPCAP84074 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HPCAP84074 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HPCAP84074 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HPCAP84074 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HPCAP84074 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPCAP84074 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPCAP84074 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPCAP84074 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HPCAP84074 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPCAP84074 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPCAP84074 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPCAP84074 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
HPCAP84074 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms