Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG7P83436 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG7P83436 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG7P83436 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG7P83436 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
COG7P83436 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG7P83436 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG7P83436 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG7P83436 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG7P83436 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG7P83436 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG7P83436 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG7P83436 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG7P83436 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG7P83436 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG7P83436 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG7P83436 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG7P83436 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG7P83436 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG7P83436 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG7P83436 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG7P83436 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
COG7P83436 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
COG7P83436 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG7P83436 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG7P83436 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG7P83436 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG7P83436 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG7P83436 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG7P83436 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG7P83436 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG7P83436 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG7P83436 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG7P83436 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG7P83436 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG7P83436 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG7P83436 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG7P83436 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG7P83436 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
COG7P83436 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG7P83436 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
COG7P83436 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
COG7P83436 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
COG7P83436 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG7P83436 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG7P83436 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG7P83436 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG7P83436 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG7P83436 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG7P83436 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG7P83436 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG7P83436 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG7P83436 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG7P83436 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
COG7P83436 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG7P83436 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG7P83436 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG7P83436 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG7P83436 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG7P83436 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
COG7P83436 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
COG7P83436 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
COG7P83436 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG7P83436 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG7P83436 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG7P83436 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
COG7P83436 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
COG7P83436 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG7P83436 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG7P83436 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG7P83436 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG7P83436 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG7P83436 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG7P83436 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG7P83436 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG7P83436 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG7P83436 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG7P83436 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG7P83436 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG7P83436 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG7P83436 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG7P83436 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG7P83436 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG7P83436 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG7P83436 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG7P83436 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG7P83436 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG7P83436 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COG7P83436 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG7P83436 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COG7P83436 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG7P83436 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG7P83436 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG7P83436 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG7P83436 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG7P83436 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG7P83436 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG7P83436 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG7P83436 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG7P83436 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms