Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBP5P82980 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBP5P82980 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBP5P82980 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBP5P82980 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBP5P82980 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBP5P82980 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RBP5P82980 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBP5P82980 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBP5P82980 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RBP5P82980 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBP5P82980 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBP5P82980 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBP5P82980 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBP5P82980 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBP5P82980 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBP5P82980 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBP5P82980 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBP5P82980 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBP5P82980 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBP5P82980 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBP5P82980 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBP5P82980 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBP5P82980 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBP5P82980 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBP5P82980 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBP5P82980 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RBP5P82980 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBP5P82980 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBP5P82980 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RBP5P82980 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBP5P82980 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBP5P82980 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBP5P82980 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RBP5P82980 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBP5P82980 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBP5P82980 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBP5P82980 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RBP5P82980 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBP5P82980 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBP5P82980 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBP5P82980 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBP5P82980 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBP5P82980 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBP5P82980 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBP5P82980 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBP5P82980 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBP5P82980 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBP5P82980 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBP5P82980 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBP5P82980 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBP5P82980 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBP5P82980 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBP5P82980 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RBP5P82980 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBP5P82980 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBP5P82980 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBP5P82980 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBP5P82980 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBP5P82980 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBP5P82980 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBP5P82980 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBP5P82980 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RBP5P82980 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBP5P82980 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RBP5P82980 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBP5P82980 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBP5P82980 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBP5P82980 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBP5P82980 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBP5P82980 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RBP5P82980 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBP5P82980 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBP5P82980 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBP5P82980 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBP5P82980 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBP5P82980 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBP5P82980 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBP5P82980 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBP5P82980 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBP5P82980 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RBP5P82980 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBP5P82980 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBP5P82980 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBP5P82980 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBP5P82980 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBP5P82980 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBP5P82980 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBP5P82980 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBP5P82980 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RBP5P82980 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RBP5P82980 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RBP5P82980 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBP5P82980 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBP5P82980 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBP5P82980 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RBP5P82980 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RBP5P82980 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBP5P82980 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBP5P82980 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms