Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL7P80098 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL7P80098 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL7P80098 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL7P80098 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL7P80098 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL7P80098 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL7P80098 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL7P80098 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL7P80098 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL7P80098 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCL7P80098 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCL7P80098 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCL7P80098 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL7P80098 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL7P80098 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL7P80098 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL7P80098 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL7P80098 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL7P80098 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL7P80098 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL7P80098 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL7P80098 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL7P80098 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL7P80098 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL7P80098 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL7P80098 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL7P80098 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL7P80098 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL7P80098 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL7P80098 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL7P80098 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL7P80098 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL7P80098 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL7P80098 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL7P80098 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL7P80098 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL7P80098 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL7P80098 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL7P80098 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL7P80098 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL7P80098 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL7P80098 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL7P80098 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL7P80098 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL7P80098 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL7P80098 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL7P80098 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL7P80098 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL7P80098 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL7P80098 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL7P80098 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL7P80098 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL7P80098 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL7P80098 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL7P80098 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL7P80098 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL7P80098 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL7P80098 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL7P80098 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL7P80098 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL7P80098 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL7P80098 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL7P80098 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL7P80098 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL7P80098 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL7P80098 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL7P80098 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL7P80098 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL7P80098 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL7P80098 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL7P80098 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL7P80098 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL7P80098 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL7P80098 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL7P80098 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL7P80098 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL7P80098 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL7P80098 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL7P80098 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCL7P80098 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCL7P80098 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL7P80098 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL7P80098 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL7P80098 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL7P80098 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL7P80098 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL7P80098 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL7P80098 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL7P80098 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL7P80098 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL7P80098 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL7P80098 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL7P80098 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL7P80098 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL7P80098 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL7P80098 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL7P80098 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL7P80098 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCL7P80098 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms