Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NOMO3P69849 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NOMO3P69849 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms