Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKP1P63208 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKP1P63208 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKP1P63208 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SKP1P63208 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SKP1P63208 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKP1P63208 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKP1P63208 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKP1P63208 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKP1P63208 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SKP1P63208 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SKP1P63208 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKP1P63208 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKP1P63208 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SKP1P63208 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKP1P63208 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKP1P63208 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKP1P63208 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SKP1P63208 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SKP1P63208 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKP1P63208 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SKP1P63208 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKP1P63208 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKP1P63208 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKP1P63208 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKP1P63208 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SKP1P63208 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKP1P63208 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKP1P63208 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKP1P63208 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKP1P63208 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKP1P63208 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKP1P63208 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SKP1P63208 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKP1P63208 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKP1P63208 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKP1P63208 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SKP1P63208 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKP1P63208 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SKP1P63208 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKP1P63208 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKP1P63208 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKP1P63208 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKP1P63208 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SKP1P63208 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKP1P63208 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SKP1P63208 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SKP1P63208 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKP1P63208 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKP1P63208 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKP1P63208 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SKP1P63208 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SKP1P63208 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKP1P63208 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SKP1P63208 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SKP1P63208 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SKP1P63208 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKP1P63208 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SKP1P63208 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKP1P63208 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKP1P63208 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKP1P63208 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.27■■□□□ 1
SKP1P63208 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKP1P63208 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SKP1P63208 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKP1P63208 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKP1P63208 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKP1P63208 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKP1P63208 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKP1P63208 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKP1P63208 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKP1P63208 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKP1P63208 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKP1P63208 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKP1P63208 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKP1P63208 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKP1P63208 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKP1P63208 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKP1P63208 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKP1P63208 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKP1P63208 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKP1P63208 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKP1P63208 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKP1P63208 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKP1P63208 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKP1P63208 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKP1P63208 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKP1P63208 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SKP1P63208 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SKP1P63208 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKP1P63208 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKP1P63208 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKP1P63208 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKP1P63208 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SKP1P63208 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKP1P63208 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKP1P63208 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKP1P63208 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKP1P63208 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKP1P63208 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms