Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL39P62891 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P62891 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P62891 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P62891 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P62891 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P62891 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P62891 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P62891 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P62891 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P62891 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P62891 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P62891 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P62891 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P62891 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P62891 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P62891 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P62891 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P62891 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P62891 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P62891 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P62891 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P62891 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P62891 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P62891 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P62891 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P62891 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P62891 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P62891 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P62891 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P62891 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P62891 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P62891 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P62891 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P62891 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P62891 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P62891 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P62891 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P62891 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P62891 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P62891 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P62891 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P62891 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P62891 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P62891 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P62891 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P62891 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P62891 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P62891 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P62891 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P62891 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P62891 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P62891 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P62891 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P62891 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL39P62891 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL39P62891 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL39P62891 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL39P62891 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL39P62891 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL39P62891 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL39P62891 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL39P62891 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL39P62891 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPL39P62891 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPL39P62891 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPL39P62891 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPL39P62891 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPL39P62891 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPL39P62891 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL39P62891 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL39P62891 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL39P62891 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL39P62891 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL39P62891 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL39P62891 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL39P62891 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL39P62891 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL39P62891 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL39P62891 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P62891 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P62891 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P62891 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P62891 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P62891 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P62891 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P62891 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P62891 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P62891 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P62891 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P62891 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P62891 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P62891 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P62891 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P62891 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P62891 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P62891 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P62891 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P62891 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P62891 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms