Protein–RNA interactions for Protein: P62837

UBE2D2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D2P62837 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2D2P62837 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms