Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UFM1P61960 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UFM1P61960 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UFM1P61960 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UFM1P61960 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UFM1P61960 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UFM1P61960 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UFM1P61960 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UFM1P61960 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UFM1P61960 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UFM1P61960 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UFM1P61960 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UFM1P61960 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UFM1P61960 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UFM1P61960 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UFM1P61960 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UFM1P61960 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UFM1P61960 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UFM1P61960 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UFM1P61960 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
UFM1P61960 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UFM1P61960 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
UFM1P61960 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
UFM1P61960 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UFM1P61960 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UFM1P61960 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UFM1P61960 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UFM1P61960 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UFM1P61960 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UFM1P61960 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UFM1P61960 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UFM1P61960 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UFM1P61960 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UFM1P61960 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UFM1P61960 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UFM1P61960 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UFM1P61960 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UFM1P61960 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UFM1P61960 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UFM1P61960 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UFM1P61960 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
UFM1P61960 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
UFM1P61960 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UFM1P61960 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UFM1P61960 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UFM1P61960 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UFM1P61960 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UFM1P61960 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UFM1P61960 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UFM1P61960 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UFM1P61960 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UFM1P61960 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UFM1P61960 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UFM1P61960 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
UFM1P61960 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UFM1P61960 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UFM1P61960 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UFM1P61960 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UFM1P61960 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UFM1P61960 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UFM1P61960 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UFM1P61960 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UFM1P61960 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
UFM1P61960 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UFM1P61960 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UFM1P61960 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UFM1P61960 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UFM1P61960 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UFM1P61960 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UFM1P61960 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UFM1P61960 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UFM1P61960 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UFM1P61960 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UFM1P61960 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UFM1P61960 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UFM1P61960 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UFM1P61960 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UFM1P61960 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UFM1P61960 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UFM1P61960 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UFM1P61960 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UFM1P61960 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UFM1P61960 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UFM1P61960 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UFM1P61960 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UFM1P61960 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UFM1P61960 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UFM1P61960 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UFM1P61960 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UFM1P61960 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UFM1P61960 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UFM1P61960 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UFM1P61960 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UFM1P61960 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UFM1P61960 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UFM1P61960 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UFM1P61960 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UFM1P61960 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UFM1P61960 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UFM1P61960 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms