Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVPABLB-1P60509 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms