Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00315P59091 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00315P59091 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms