Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RHBDL3P58872 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHBDL3P58872 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms