Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM3BP58499 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM3BP58499 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM3BP58499 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM3BP58499 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM3BP58499 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM3BP58499 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM3BP58499 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM3BP58499 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM3BP58499 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM3BP58499 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM3BP58499 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM3BP58499 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM3BP58499 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM3BP58499 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM3BP58499 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM3BP58499 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM3BP58499 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM3BP58499 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM3BP58499 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM3BP58499 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM3BP58499 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM3BP58499 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM3BP58499 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM3BP58499 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM3BP58499 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM3BP58499 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FAM3BP58499 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
FAM3BP58499 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FAM3BP58499 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3BP58499 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms