Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSX2P58304 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VSX2P58304 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSX2P58304 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSX2P58304 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSX2P58304 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSX2P58304 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSX2P58304 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSX2P58304 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSX2P58304 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSX2P58304 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSX2P58304 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSX2P58304 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSX2P58304 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSX2P58304 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VSX2P58304 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSX2P58304 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSX2P58304 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSX2P58304 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSX2P58304 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSX2P58304 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSX2P58304 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSX2P58304 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSX2P58304 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSX2P58304 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSX2P58304 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSX2P58304 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSX2P58304 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSX2P58304 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSX2P58304 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSX2P58304 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VSX2P58304 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VSX2P58304 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSX2P58304 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSX2P58304 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSX2P58304 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSX2P58304 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSX2P58304 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSX2P58304 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VSX2P58304 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VSX2P58304 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VSX2P58304 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VSX2P58304 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VSX2P58304 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VSX2P58304 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VSX2P58304 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VSX2P58304 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VSX2P58304 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VSX2P58304 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VSX2P58304 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VSX2P58304 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VSX2P58304 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VSX2P58304 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VSX2P58304 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VSX2P58304 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VSX2P58304 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VSX2P58304 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
VSX2P58304 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VSX2P58304 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VSX2P58304 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VSX2P58304 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VSX2P58304 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VSX2P58304 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSX2P58304 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSX2P58304 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSX2P58304 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSX2P58304 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSX2P58304 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSX2P58304 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSX2P58304 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSX2P58304 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSX2P58304 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VSX2P58304 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSX2P58304 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSX2P58304 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSX2P58304 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VSX2P58304 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSX2P58304 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSX2P58304 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSX2P58304 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSX2P58304 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSX2P58304 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSX2P58304 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VSX2P58304 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VSX2P58304 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VSX2P58304 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSX2P58304 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSX2P58304 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSX2P58304 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSX2P58304 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSX2P58304 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSX2P58304 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSX2P58304 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSX2P58304 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSX2P58304 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSX2P58304 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VSX2P58304 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VSX2P58304 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VSX2P58304 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VSX2P58304 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms