Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBASH3AP57075 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms