Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STX17P56962 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STX17P56962 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STX17P56962 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STX17P56962 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STX17P56962 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STX17P56962 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STX17P56962 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STX17P56962 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STX17P56962 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STX17P56962 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STX17P56962 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STX17P56962 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STX17P56962 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STX17P56962 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STX17P56962 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
STX17P56962 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STX17P56962 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
STX17P56962 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STX17P56962 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STX17P56962 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STX17P56962 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STX17P56962 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STX17P56962 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STX17P56962 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STX17P56962 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STX17P56962 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STX17P56962 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STX17P56962 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STX17P56962 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STX17P56962 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STX17P56962 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STX17P56962 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STX17P56962 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX17P56962 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX17P56962 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX17P56962 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX17P56962 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX17P56962 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX17P56962 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX17P56962 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX17P56962 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX17P56962 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
STX17P56962 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX17P56962 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX17P56962 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX17P56962 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STX17P56962 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STX17P56962 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STX17P56962 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STX17P56962 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STX17P56962 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STX17P56962 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX17P56962 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX17P56962 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX17P56962 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX17P56962 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX17P56962 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX17P56962 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX17P56962 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX17P56962 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX17P56962 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STX17P56962 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STX17P56962 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STX17P56962 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STX17P56962 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STX17P56962 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STX17P56962 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STX17P56962 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STX17P56962 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STX17P56962 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STX17P56962 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STX17P56962 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STX17P56962 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STX17P56962 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STX17P56962 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STX17P56962 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STX17P56962 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
STX17P56962 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
STX17P56962 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
STX17P56962 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
STX17P56962 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
STX17P56962 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STX17P56962 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STX17P56962 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
STX17P56962 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STX17P56962 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STX17P56962 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STX17P56962 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STX17P56962 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STX17P56962 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STX17P56962 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STX17P56962 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STX17P56962 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STX17P56962 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STX17P56962 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STX17P56962 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX17P56962 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX17P56962 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX17P56962 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms