Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN8P56748 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms