Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLDN15P56746 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN15P56746 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN15P56746 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN15P56746 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN15P56746 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN15P56746 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN15P56746 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN15P56746 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN15P56746 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms