Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME5P56597 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME5P56597 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME5P56597 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NME5P56597 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME5P56597 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME5P56597 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME5P56597 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME5P56597 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NME5P56597 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME5P56597 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME5P56597 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME5P56597 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME5P56597 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME5P56597 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME5P56597 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME5P56597 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME5P56597 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME5P56597 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME5P56597 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME5P56597 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME5P56597 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME5P56597 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME5P56597 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME5P56597 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME5P56597 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME5P56597 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME5P56597 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME5P56597 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME5P56597 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME5P56597 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME5P56597 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME5P56597 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NME5P56597 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME5P56597 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME5P56597 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME5P56597 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME5P56597 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME5P56597 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME5P56597 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME5P56597 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME5P56597 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME5P56597 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME5P56597 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME5P56597 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME5P56597 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME5P56597 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME5P56597 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME5P56597 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME5P56597 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME5P56597 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME5P56597 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME5P56597 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME5P56597 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME5P56597 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME5P56597 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME5P56597 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME5P56597 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NME5P56597 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME5P56597 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME5P56597 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME5P56597 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME5P56597 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME5P56597 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME5P56597 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME5P56597 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME5P56597 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME5P56597 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME5P56597 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NME5P56597 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME5P56597 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME5P56597 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME5P56597 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME5P56597 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME5P56597 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NME5P56597 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NME5P56597 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME5P56597 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME5P56597 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME5P56597 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME5P56597 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME5P56597 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME5P56597 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME5P56597 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME5P56597 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME5P56597 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME5P56597 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME5P56597 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NME5P56597 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME5P56597 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME5P56597 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME5P56597 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME5P56597 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME5P56597 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME5P56597 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME5P56597 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME5P56597 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME5P56597 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME5P56597 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME5P56597 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms