Protein–RNA interactions for Protein: P56199

ITGA1, Integrin alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA1P56199 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA1P56199 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms