Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms