Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC13P55735 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC13P55735 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC13P55735 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC13P55735 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC13P55735 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC13P55735 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC13P55735 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC13P55735 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC13P55735 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC13P55735 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC13P55735 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC13P55735 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC13P55735 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC13P55735 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC13P55735 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC13P55735 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC13P55735 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC13P55735 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC13P55735 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC13P55735 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC13P55735 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC13P55735 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC13P55735 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC13P55735 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC13P55735 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC13P55735 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC13P55735 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC13P55735 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC13P55735 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC13P55735 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC13P55735 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC13P55735 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC13P55735 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC13P55735 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC13P55735 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC13P55735 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC13P55735 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC13P55735 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC13P55735 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC13P55735 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC13P55735 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC13P55735 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC13P55735 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC13P55735 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC13P55735 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC13P55735 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC13P55735 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC13P55735 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC13P55735 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC13P55735 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC13P55735 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEC13P55735 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC13P55735 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC13P55735 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC13P55735 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC13P55735 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC13P55735 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC13P55735 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC13P55735 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC13P55735 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC13P55735 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC13P55735 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC13P55735 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC13P55735 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC13P55735 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC13P55735 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC13P55735 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC13P55735 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC13P55735 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC13P55735 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC13P55735 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC13P55735 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC13P55735 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC13P55735 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC13P55735 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC13P55735 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC13P55735 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC13P55735 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC13P55735 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC13P55735 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC13P55735 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC13P55735 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC13P55735 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC13P55735 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC13P55735 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC13P55735 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC13P55735 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC13P55735 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC13P55735 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC13P55735 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC13P55735 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC13P55735 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC13P55735 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC13P55735 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC13P55735 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC13P55735 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC13P55735 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC13P55735 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC13P55735 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms