Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPD52P55327 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPD52P55327 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPD52P55327 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPD52P55327 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPD52P55327 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TPD52P55327 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPD52P55327 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPD52P55327 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPD52P55327 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPD52P55327 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPD52P55327 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPD52P55327 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPD52P55327 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPD52P55327 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPD52P55327 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPD52P55327 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPD52P55327 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPD52P55327 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPD52P55327 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPD52P55327 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPD52P55327 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPD52P55327 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPD52P55327 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPD52P55327 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPD52P55327 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPD52P55327 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPD52P55327 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPD52P55327 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPD52P55327 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPD52P55327 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TPD52P55327 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPD52P55327 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPD52P55327 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPD52P55327 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPD52P55327 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPD52P55327 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TPD52P55327 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPD52P55327 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPD52P55327 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPD52P55327 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPD52P55327 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPD52P55327 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPD52P55327 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPD52P55327 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPD52P55327 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPD52P55327 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPD52P55327 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPD52P55327 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPD52P55327 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPD52P55327 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPD52P55327 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPD52P55327 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TPD52P55327 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPD52P55327 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TPD52P55327 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPD52P55327 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPD52P55327 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TPD52P55327 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPD52P55327 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPD52P55327 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPD52P55327 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPD52P55327 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPD52P55327 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPD52P55327 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPD52P55327 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPD52P55327 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPD52P55327 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPD52P55327 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPD52P55327 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPD52P55327 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPD52P55327 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPD52P55327 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPD52P55327 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPD52P55327 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPD52P55327 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPD52P55327 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TPD52P55327 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPD52P55327 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPD52P55327 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPD52P55327 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPD52P55327 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPD52P55327 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPD52P55327 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPD52P55327 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPD52P55327 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TPD52P55327 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPD52P55327 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPD52P55327 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPD52P55327 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPD52P55327 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPD52P55327 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPD52P55327 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPD52P55327 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPD52P55327 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPD52P55327 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPD52P55327 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPD52P55327 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPD52P55327 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPD52P55327 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms