Protein–RNA interactions for Protein: P54278

PMS2, Mismatch repair endonuclease PMS2, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P54278 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PMS2P54278 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PMS2P54278 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PMS2P54278 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PMS2P54278 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PMS2P54278 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PMS2P54278 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PMS2P54278 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PMS2P54278 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PMS2P54278 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PMS2P54278 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PMS2P54278 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PMS2P54278 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PMS2P54278 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PMS2P54278 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PMS2P54278 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PMS2P54278 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PMS2P54278 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PMS2P54278 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PMS2P54278 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PMS2P54278 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PMS2P54278 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PMS2P54278 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PMS2P54278 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PMS2P54278 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PMS2P54278 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PMS2P54278 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PMS2P54278 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PMS2P54278 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PMS2P54278 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PMS2P54278 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PMS2P54278 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PMS2P54278 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PMS2P54278 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PMS2P54278 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PMS2P54278 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PMS2P54278 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PMS2P54278 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PMS2P54278 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PMS2P54278 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PMS2P54278 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PMS2P54278 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PMS2P54278 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PMS2P54278 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PMS2P54278 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PMS2P54278 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PMS2P54278 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PMS2P54278 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PMS2P54278 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PMS2P54278 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PMS2P54278 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PMS2P54278 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PMS2P54278 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PMS2P54278 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PMS2P54278 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PMS2P54278 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PMS2P54278 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PMS2P54278 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PMS2P54278 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PMS2P54278 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PMS2P54278 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PMS2P54278 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PMS2P54278 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PMS2P54278 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PMS2P54278 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMS2P54278 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMS2P54278 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMS2P54278 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMS2P54278 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMS2P54278 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMS2P54278 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMS2P54278 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMS2P54278 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PMS2P54278 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMS2P54278 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMS2P54278 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PMS2P54278 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMS2P54278 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMS2P54278 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMS2P54278 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMS2P54278 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMS2P54278 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMS2P54278 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMS2P54278 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMS2P54278 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMS2P54278 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMS2P54278 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMS2P54278 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMS2P54278 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMS2P54278 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMS2P54278 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMS2P54278 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PMS2P54278 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PMS2P54278 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PMS2P54278 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PMS2P54278 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PMS2P54278 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMS2P54278 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMS2P54278 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMS2P54278 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms