Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUCLG1P53597 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms