Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms