Protein–RNA interactions for Protein: P53122

YGL138C, Uncharacterized protein YGL138C, yeast

Predictions only

Length 345 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YGL138C	P53122	tK(CUU)E1	tK(CUU)E1	73 nt		4.9	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	tK(CUU)E2	tK(CUU)E2	73 nt		4.9	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	tK(CUU)F	tK(CUU)F	73 nt		4.9	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	tK(CUU)G1	tK(CUU)G1	73 nt		4.9	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	tK(CUU)G2	tK(CUU)G2	73 nt		4.9	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	tK(CUU)G3	tK(CUU)G3	73 nt		4.9	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	tK(CUU)I	tK(CUU)I	73 nt		4.9	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	tK(CUU)J	tK(CUU)J	73 nt		4.9	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	tK(CUU)K	tK(CUU)K	73 nt		4.9	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	tK(CUU)M	tK(CUU)M	73 nt		4.9	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	tK(CUU)P	tK(CUU)P	73 nt		4.9	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	GPP1	YIL053W	753 nt		4.9	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	YNG1	YOR064C	660 nt		4.9	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	YOR379C	YOR379C	339 nt		4.9	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	YPL073C	YPL073C	486 nt		4.9	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	YMR221C	YMR221C	1515 nt		4.9	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	LYP1	YNL268W	1836 nt		4.9	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	MST1	YKL194C	1389 nt		4.9	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	MAL13	YGR288W	1422 nt		4.89	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	TSL1	YML100W	3297 nt		4.89	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	YJR085C	YJR085C	318 nt		4.89	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	YLL017W	YLL017W	312 nt		4.89	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	RRN9	YMR270C	1098 nt		4.89	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	RER1	YCL001W	567 nt		4.89	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	PAH1	YMR165C	2589 nt		4.89	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	BOP2	YLR267W	1713 nt		4.89	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	YIL001W	YIL001W	1542 nt		4.88	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	PER1	YCR044C	1074 nt		4.88	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	LUC7	YDL087C	786 nt		4.88	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	YLR124W	YLR124W	345 nt		4.88	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	RPL15B	YMR121C	615 nt		4.88	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	COG5	YNL051W	1212 nt		4.88	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	YNL143C	YNL143C	393 nt		4.88	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	RRP40	YOL142W	723 nt		4.88	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	EAR1	YMR171C	1653 nt		4.88	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	HER2	YMR293C	1395 nt		4.88	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	IMA1	YGR287C	1770 nt		4.88	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	IMA3	YIL172C	1770 nt		4.88	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	IMA4	YJL221C	1770 nt		4.88	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	PHM7	YOL084W	2976 nt		4.88	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	PSE1	YMR308C	3270 nt		4.87	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	HXT7	YDR342C	1713 nt		4.87	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	HXT6	YDR343C	1713 nt		4.87	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	snR7-S	snR7-S	179 nt		4.87	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	SUR2	YDR297W	1050 nt		4.87	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	FMP46	YKR049C	402 nt		4.87	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	TVP38	YKR088C	1014 nt		4.87	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	MDY2	YOL111C	639 nt		4.87	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	NRG2	YBR066C	663 nt		4.87	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	OMS1	YDR316W	1416 nt		4.87	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	SVF1	YDR346C	1446 nt		4.87	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	YKL169C	YKL169C	384 nt		4.86	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	RMI1	YPL024W	726 nt		4.86	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	ARC40	YBR234C	1155 nt		4.86	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	NUP2	YLR335W	2163 nt		4.86	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	GDH2	YDL215C	3279 nt		4.86	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	FKH1	YIL131C	1455 nt		4.86	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	PAN1	YIR006C	4443 nt		4.86	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	PXA1	YPL147W	2613 nt		4.86	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	HIS4	YCL030C	2400 nt		4.85	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	COQ4	YDR204W	1008 nt		4.85	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	GRX4	YER174C	735 nt		4.85	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	FRA2	YGL220W	363 nt		4.85	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	PSR1	YLL010C	1284 nt		4.85	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	YET2	YMR040W	483 nt		4.85	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	YIM1	YMR152W	1098 nt		4.85	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	ISA2	YPR067W	558 nt		4.85	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	TFC7	YOR110W	1308 nt		4.85	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	MCX1	YBR227C	1563 nt		4.85	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	RFT1	YBL020W	1725 nt		4.85	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	SEC9	YGR009C	1956 nt		4.85	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	TIP20	YGL145W	2106 nt		4.85	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	GCR1	YPL075W	2358 nt		4.84	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	YNL095C	YNL095C	1929 nt		4.84	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	PSY4	YBL046W	1326 nt		4.84	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	OCA4	YCR095C	1089 nt		4.84	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	TAF10	YDR167W	621 nt		4.84	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	LOH1	YJL038C	660 nt		4.84	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	YLR157W-D	YLR157W-D	213 nt		4.84	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	CYK3	YDL117W	2658 nt		4.84	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	SUL2	YLR092W	2682 nt		4.84	□□□□□ -1.63
YGL138C	P53122	JHD2	YJR119C	2187 nt		4.84	□□□□□ -1.64
YGL138C	P53122	MET4	YNL103W	2019 nt		4.84	□□□□□ -1.64
YGL138C	P53122	UBC1	YDR177W	648 nt		4.83	□□□□□ -1.64
YGL138C	P53122	TEF4	YKL081W	1239 nt		4.83	□□□□□ -1.64
YGL138C	P53122	RPS0B	YLR048W	759 nt		4.83	□□□□□ -1.64
YGL138C	P53122	YLR402W	YLR402W	192 nt		4.83	□□□□□ -1.64
YGL138C	P53122	ROT1	YMR200W	771 nt		4.83	□□□□□ -1.64
YGL138C	P53122	PPA2	YMR267W	933 nt		4.83	□□□□□ -1.64
YGL138C	P53122	PDX3	YBR035C	687 nt		4.83	□□□□□ -1.64
YGL138C	P53122	CTF18	YMR078C	2226 nt		4.82	□□□□□ -1.64
YGL138C	P53122	STB3	YDR169C	1542 nt		4.82	□□□□□ -1.64
YGL138C	P53122	NUP42	YDR192C	1293 nt		4.82	□□□□□ -1.64
YGL138C	P53122	BUR6	YER159C	429 nt		4.82	□□□□□ -1.64
YGL138C	P53122	YIL021C-A	YIL021C-A	270 nt		4.82	□□□□□ -1.64
YGL138C	P53122	YLR407W	YLR407W	687 nt		4.82	□□□□□ -1.64
YGL138C	P53122	YBL010C	YBL010C	843 nt		4.82	□□□□□ -1.64
YGL138C	P53122	CYM1	YDR430C	2970 nt		4.82	□□□□□ -1.64
YGL138C	P53122	YHR177W	YHR177W	1362 nt		4.81	□□□□□ -1.64
YGL138C	P53122	PEX29	YDR479C	1665 nt		4.81	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.4 ms