Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
THOP1P52888 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
THOP1P52888 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THOP1P52888 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THOP1P52888 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THOP1P52888 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THOP1P52888 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THOP1P52888 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
THOP1P52888 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THOP1P52888 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THOP1P52888 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THOP1P52888 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THOP1P52888 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THOP1P52888 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THOP1P52888 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THOP1P52888 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THOP1P52888 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THOP1P52888 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THOP1P52888 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THOP1P52888 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THOP1P52888 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THOP1P52888 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THOP1P52888 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
THOP1P52888 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THOP1P52888 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THOP1P52888 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THOP1P52888 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THOP1P52888 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THOP1P52888 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THOP1P52888 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
THOP1P52888 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THOP1P52888 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THOP1P52888 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THOP1P52888 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THOP1P52888 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THOP1P52888 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THOP1P52888 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THOP1P52888 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THOP1P52888 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THOP1P52888 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THOP1P52888 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
THOP1P52888 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
THOP1P52888 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THOP1P52888 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THOP1P52888 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
THOP1P52888 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THOP1P52888 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THOP1P52888 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THOP1P52888 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THOP1P52888 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THOP1P52888 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THOP1P52888 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THOP1P52888 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THOP1P52888 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THOP1P52888 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THOP1P52888 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THOP1P52888 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
THOP1P52888 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THOP1P52888 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THOP1P52888 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THOP1P52888 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THOP1P52888 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THOP1P52888 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THOP1P52888 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
THOP1P52888 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THOP1P52888 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THOP1P52888 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THOP1P52888 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THOP1P52888 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THOP1P52888 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THOP1P52888 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THOP1P52888 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
THOP1P52888 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
THOP1P52888 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
THOP1P52888 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
THOP1P52888 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
THOP1P52888 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THOP1P52888 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THOP1P52888 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THOP1P52888 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THOP1P52888 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THOP1P52888 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THOP1P52888 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THOP1P52888 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THOP1P52888 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THOP1P52888 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THOP1P52888 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THOP1P52888 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THOP1P52888 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THOP1P52888 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
THOP1P52888 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THOP1P52888 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
THOP1P52888 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THOP1P52888 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THOP1P52888 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THOP1P52888 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THOP1P52888 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THOP1P52888 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THOP1P52888 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THOP1P52888 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms