Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFNA3P52797 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms