Protein–RNA interactions for Protein: P52744

ZNF138, Zinc finger protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF138P52744 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF138P52744 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms